2011年1月31日，费尔南多·托雷斯转会切尔西，身穿9号球衣，但他在第14场比赛中只打进1球，在雨中的斯坦福桥球场攻破西汉姆的球门，这也是他2010-11赛季为切尔西打进的唯一进球，

费尔南多·托雷斯经历一个夏天的恢复休整后，在2011-12赛季当中，首轮对斯托克城费尔南多·托雷斯虽未进球，但也表现优异。此后客场1：3不敌曼联的比赛中，费尔南多·托雷斯打进一球。

在最后时段带球越过德赫亚，却错过了将球送入空门的机会，随后欧冠5：0大胜亨克一战中，费尔南多·托雷斯梅开二度，但在年末阶段他陷入了进球荒。

2012年3月28日，费尔南多·托雷斯在欧冠8强对本菲卡的比赛中虽然没有进球，但转而为队友创造机会，在客场对本菲卡时，边路突破后防助攻卡卢打入关键一球，4月25日，欧冠半决赛次回合切尔西客场2：2逼平巴塞罗那。

从而总比分3：2淘汰巴萨，费尔南多·托雷斯为切尔西打进扳平一球，4月29日，英超第36轮，在切尔西对女王公园巡游者的比赛中，费尔南多·托雷斯完成了切尔西首个帽子戏法，帮助切尔西6：1战胜巡游者。

2012年5月5日，2011-12赛季第131届英格兰足总杯决赛，切尔西在温布利大球场对阵利物浦，费尔南多·托雷斯作为替补并未登场。

但切尔西最终还是2：1击败了利物浦，历史上第7次捧起足总杯，近6年来4夺该项赛事冠军，2012年5月20日，2011-12赛季欧冠联赛决赛在慕尼黑安联球场展开争夺，费尔南多·托雷斯替补登场。

在终场前两分钟争得切尔西全场唯一的一个角球，德罗巴利用这个角球头球破门扳平比分。

点球大战后切尔西总比分5：4击败拜仁，历史上首次获得欧冠冠军，2012年8月12日，2012-13赛季英格兰社区盾杯赛在伯明翰的维拉球场展开争夺，切尔西2：3输给曼城。

费尔南多·托雷斯先拔头筹，伊万诺维奇随后被红牌罚下，曼城连入3球逆转，失掉冠军，费尔南多·托雷斯在随后的对阵雷丁和纽卡斯尔的联赛当中连续破门。

并在切尔西客场对阵阿森纳那次2：1的胜利中为蓝军首开纪录，可随后在切尔西主场2：3不敌曼联的比赛中，费尔南多·托雷斯因为一次颇具争议的判罚，领到了蓝军生涯的第二张红牌被罚下场。

录像回放清晰地显示出他
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