时间倒回到二战时期，一支小日子国的阴阳师关东军占领了辽东，在渤海海域与霸下发生了激烈的冲突。
为首的阴阳师头领叫做梅川一郎。
由于当地生灵涂炭，霸下不忍心，开始不断偷袭小日子军队。彼时的霸下虽然攻击性不强，但是对付那些小日子人还是绰绰有余的。
后来，阴阳师们找到了霸下，放出了各种各样的式神进行攻击，然而霸下仅凭自己一只海龟就干掉了整整一个支队的阴阳师。凭借着自己的防御龟壳，任凭对方如何攻击都无法伤害霸下分毫。
再后来，小日子人调集了重武器对霸下所在的浅海进行不分昼夜的狂轰滥炸，霸下灵力消耗太大，只好转而躲在了深海……
小日子国战败投降后，侥幸逃回国的梅川一郎在天皇的授意下，组建了新的生物实验室，接收融合了以前的731部队，形成了如今的超自然防卫科。
梅川一郎对霸下印象深刻，一生致力于一件事，就是研发出一个机械霸下。经过几代超自然防卫科的努力，还真的让他们在海下完成了一项巨大的工程。
这个假的机械霸下，就建设在小日子海下。传言占地面积足足有一个湾湾岛那么大……
……
高温末世来临后，小日子列岛在持续的地壳变动与海平面上升中，早就已经彻底沉入水下。
曾经繁华的东京塔、大阪城，如今只剩下扭曲的钢筋骨架，在海里被变异鱼群当作了巢穴。
但是，小日子人并没有灭绝。这个穷凶极恶的民族，生命力极其顽强。
因为自从二战末期，他们就着手建设了以机械霸下为核心的水下移动堡垒。
末世以后，以天皇为首的高官包括一部分臣民，全部转移到了机械霸下内居住。
而超自然防卫科执行的另一项秘密研究，就是「核污染净化の计划」。
由于他们长期在海水里大量排放核污水，需要对本岛周围的海域进行净化，至于世界其他地方的海水，他们才不管呢。
这项计划的核心就是变异发光多泡水母，这是小日子实验室利用华人华侨进行活体实验，不断研发，最终研制出来的。
……
此时此刻，霸下的本体透明作战舱内，那只被捉到的发光水母，断断续续地讲完了以上的故事。
并且，他利用自己的记忆碎片将知道的所有事情投屏到了墙面，形成了全息投影。
他绝望地哭诉道，“他，他
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